В структуру Института развития Университета на момент основания вошли:- Отдел стратегического планирования;
— Отдел системы мененджмента качества;
— Центр мониторинга анализа качества образования и научного сопровождения реформы медицинского образования;
— Группа аккредитации и рейтинга;
— Школа педагогического мастерства имени Х.С.Насыбуллиной.